房山石經(jīng)的鐫刻和儲藏，歷史久遠，與其同時建造的云居寺，歷史也可謂漫長?？探?jīng)需要寺，寺因刻經(jīng)而更興旺發(fā)達，互相促進，相得益彰。

關于云居寺的始建時間，許多人認為是靜琬刻經(jīng)時所建，其實不然。據(jù)遼天慶七年(公元1117年)《大遼燕京涿州范陽縣白帶山石經(jīng)云居寺釋迦佛舍利塔記》載：“案諸傳記并起寺碑，原其此寺始自北齊(公元550—577年)，迄至隋代，有幽州智泉寺沙門智苑，……發(fā)心磨瑩貞石鐫造大藏經(jīng)，以備法滅?！笨芍凭铀率冀ㄓ诒饼R。再參照“涿鹿山石經(jīng)堂者，始自北齊”的記載，以及北齊時鄴都佛教、佛學、刻經(jīng)盛況，云居寺和華嚴堂均始于北齊的說法是可信的，只是具體建造情況難考。

關于唐臨《冥報記》所載靜琬修建云居寺的故事，剔除其穿鑿附會部分，利用其合理的材料，則可證明靜琬當時在選中了石經(jīng)山和原有洞穴，發(fā)愿刻經(jīng)久貯的同時，確實還擴建了云居寺，正如《冥報記》中所言：“苑嘗以役匠既多，道俗奔湊，欲于巖前造木佛堂并食堂寢屋，而念木瓦難辦，恐分費經(jīng)物，故未能起作?！较掠写笏砂財?shù)千株，……苑乃使匠擇其木，邑里喜悅而共助造堂宇，頃之畢成，皆如其志焉?！边@應是云居寺的第一次擴建而不是始建。從其有佛堂、食堂、寢室，能滿足役匠既多的要求，用料又達數(shù)千根等判斷，當時擴建的規(guī)模還是不小的。其后在唐高宗總章二年(公元669年)題刻中，就首次出現(xiàn)了“云居”二字。

9世紀中期，云居寺又再次擴建。何籌撰《大唐云居寺故事主律大德神道碑銘并序》曰：“大德……曾于本院，別起道□(壇)，請高行數(shù)人，轉藏經(jīng)七遍?！蠛途澎?公元835年)秋下旬有三日示疾，歸寂于本寺東院。”

遼代，在穆宗耶律璟的積極支持下，云居寺又得到一次大規(guī)模的修建和擴建。寺內“題記”載：“皇朝應歷十四載(公元964年)，寺主苾蒭[bi chu 必除](即比丘)謙諷完葺一寺，結邑千人。請右補闕瑯玡王公作碑，其文稱最，或傳于竹帛，或記于肺腑，或誦在口者眾矣。”“和尚則歷綱維、典寺事，見風雨之壞者及兵火之殘者，補政紹隆，迭有次序。以壇物畢萃于十方，故建庫房一座，五間六架；以庖人可供于四眾，故建……。”可知謙諷和尚數(shù)十年間，先后主持建造了佛殿、講堂、經(jīng)房及附屬建筑物等，大小共計67間有余。可惜的是，“因兵火遂至傷缺”。因此，出現(xiàn)了“補缺子諸行宮都部署判官都官員外郎賜紫金魚袋教(即王政子王教)，念先人遺跡，出俸錢再修”之事。

到了金代，云居寺再次修建、改建。據(jù)《謙公法師靈塔銘》云：“大定二十五年(公元1185年)有茲院大眾、本里壇信以施。……施者重修廊宇，別建僧庵，西序東廚，煥然頂新?！?/p>

元明時期，云居寺只有一些小型修繕活動。《游小西天記》載：“弘治九年(公元1496年)二月中旬，際遇□□大石窩開塘取石，督工之暇，觀其殿像傾廢，故發(fā)誠心，傭工重建，復將□□□置于內，加以粉地，繪畫其上，如此煥然一新，將見神有所依，人有所仰……?！?/p>

綜觀歷代記載，云居寺從始建至1940年前后被日本侵略軍全部焚毀，至少有五次大的修建和擴建?，F(xiàn)已在云居寺廢墟上建立文物庫房，對塔及石經(jīng)進行保管整理。

與房山云居寺塔同時或前后修建的各類塔，從唐至遼代大約有10余座，形成了當?shù)刂乃?。至今尚存的有七座，最早的一座為唐景云二?公元711年)王璬〔jiao皎〕造石浮圖，最晚的一座為遼天慶八年(公元1114年)建造的小型八角石塔。

目前在云居寺的北側尚存一座遼塔，其四隅分別建有精美的小石塔，建筑年代分別為唐景云二年(公元711年)、太極元年(公元712年)、開元十年(公元722年)、開元十五年(公元727年)，可見北塔塔基應是唐代遺跡。現(xiàn)存正中北塔將樓閣式、覆缽式二者結合為一，形制較異。有人認為再將四隅小塔統(tǒng)一起來觀察，則是金剛寶塔的雛型，可備一說。云居寺各塔中，多數(shù)塔身都有浮圖或題記，是研究石經(jīng)山和云居寺的重要資料。