維吾爾醫(yī)學有著悠久的歷史，如現(xiàn)存在柏林的回鶻文醫(yī)學文獻，其中有一本內(nèi)容是醫(yī)治各種疾病藥方的通俗醫(yī)書，這本書雖然殘缺不全，但內(nèi)容仍較廣，包括有臨床各種癥狀和病癥，藥物治療、療法，以及其他資料，涉及的臨床各科有內(nèi)科、外科、皮膚科、婦科、眼科、牙科、泌尿科、耳鼻喉和精神病科，內(nèi)容包括各種疾病、癥狀共41種。

著名的古代維吾爾族醫(yī)學著作有回回醫(yī)學文獻、回回藥方三十六卷、馬合爾哈肉孜米下衣、達司吐衣拉兒、醫(yī)學由司比等。

維吾爾醫(yī)學在發(fā)展過程中，不僅吸收了中醫(yī)學的精華，同時吸收借鑒印度、波斯、巴基斯坦、古希臘等國家的醫(yī)學精華，創(chuàng)造地發(fā)展了它的基礎(chǔ)理論藥物學和醫(yī)療技術(shù)。

維吾爾醫(yī)醫(yī)學理論過去長期以“土、水、火、氣”為物質(zhì)基礎(chǔ)，以血津、痰津、膽津、黑膽津等“四津”體液學說解釋人體與自然環(huán)境的關(guān)系，且還創(chuàng)立了一診斷和治療疾病的方法。在診斷方面與中醫(yī)的脈診有相同之處，常以“查脈”、“望診 ”、“問診”等方法診斷疾病。分析脈象有10類35種，包括鋸木式、波浪式、蜥蝎式、釘釘式、鼠行疾促式等。內(nèi)科方面，常以內(nèi)服藥為主，一般將藥制成糖漿劑、膏劑，同時運用熏藥、坐藥、放血、熱敷、冷水療、拔火罐、飲食醫(yī)療等11種療法。藥劑方面，有主藥和附藥之分。臨床常用復(fù)合劑，幾種藥進行合成，多者用50味，少者用10味?？诜巹┲杏刑菨{劑、水果漿劑、丸劑、粉劑、膏劑、油劑、蒸餾劑、煎劑、浸劑、片劑等多種。

維吾爾醫(yī)在長期發(fā)展中，經(jīng)過多人努力總結(jié)，逐漸在治療白癜風、心腦血管疾病、精神病、骨科病、風濕病、腸胃病、肝膽病、結(jié)石等疾病方面積累了豐富的經(jīng)驗，治療效果明顯。尤其在治療白癜風方面，療效獨特。從宋元時期流傳至今，對白癜風的治療是維吾爾族醫(yī)學有代表性的成果之一?，F(xiàn)在喀什、和田的維吾爾醫(yī)院，就是以治療白癜風卓有成效而享有較高聲譽?！八沟┝孔⑸湟骸笔呛吞铼殑?chuàng)的一種治療白癜風的藥劑，治愈率達到80%，受到自治區(qū)有關(guān)專家的重視。